肠道菌群不包括人类的细胞。肠道菌群主要由各种微生物组成，包括细菌、真菌、病毒和寄生虫等。这些微生物通过与人类共生，相互作用，发挥多种生理功能，如帮助消化食物、合成维生素、调节免疫系统等。但这些微生物并不属于人类自身的细胞。
肠道的主要功能是消化吸收、屏障防护、免疫调节三个。肠道黏膜形成了一道天然防护屏障，能够阻挡食物带入的有害病菌、毒素，以及未完全分解的大分子异物进入人体血液循环，避免这些有害物质对其他器官组织造成侵害，维持身体内环境的稳定。
