存在于大肠中的主要细菌主要包括：
1. 基本菌群：包括大肠杆菌（Escherichia coli）、肠球菌（Enterococcus faecalis）、肠杆菌（Klebsiella pneumoniae）等。
2. 变形菌：包括变形菌（Proteus mirabilis）、产气杆菌（Enterobacter aerogenes）等。
3. 嗜酸乳杆菌：包括嗜酸乳杆菌（Lactobacillus acidophilus）等。
4. 再生难培养细菌：包括难培养细菌（Bacteroides fragilis）等。
这些细菌在大肠中起到重要的生理功能，例如有助于消化食物、合成维生素、抵抗有害细菌和维持肠道健康等。
