大部分轻度肠道功能紊乱可以自行恢复，中重度、病程较长的肠道功能紊乱通常无法自己好，需要医学干预。
1. 能自行恢复的都是症状轻、病程短的情况。大多是近期饮食不规律、吃了太多刺激性食物、短期压力大或者熬夜着凉诱发的，仅表现为偶尔腹胀、排便不成型或者轻微便秘，没有明显腹痛、体重下降这些问题。只要及时改掉诱发的不良习惯，肠道的蠕动功能和菌群平衡可以慢慢自行调整回来，一般1~2周左右就能恢复正常。
2. 无法自己好的多是症状重、持续时间久的情况。如果肠道紊乱已经持续了几个月，经常反复腹痛、腹泻便秘交替，还伴随明显的乏力、焦虑失眠，或是本身就有焦虑症、糖尿病、甲状腺疾病这类基础病，肠道的神经调节功能、菌群环境已经形成了长期的失衡状态，仅靠身体自我调节很难恢复正常，不及时干预还会慢慢发展成慢性功能性肠病，反复影响生活质量。
3. 不管轻重都不要被动等着自愈。哪怕是轻度紊乱，也需要主动调整饮食和生活习惯，比如少吃生冷辛辣刺激食物、规律三餐、尽量不熬夜、学会缓解情绪压力，才能更快恢复。如果调整3~5天症状没有缓解，甚至越来越重，一定要及时就医，不要硬扛拖成慢性问题。
