喝益生菌后出现肛门下坠，大多是肠道菌群调整过程中的一过性正常反应，少数与个体不耐受、本身存在基础肛肠肠道疾病有关。
1、肠道菌群调整的应激反应。原本肠道内有害菌占比偏高，补充外源性益生菌后，原有菌群平衡被打破重新建立，这个过程中会出现肠道蠕动加快、肠道产气增多的情况，过多气体和蠕动刺激直肠黏膜后，就会产生肛门下坠的感觉，这种不适一般都是一过性的，持续三五天适应之后就会自行消失。
2、个体不耐受或过敏反应。部分人会对益生菌所含的特定菌株，或是益生菌制剂里添加的辅料（比如乳糖、甜味剂、防腐剂）产生不耐受或过敏，引发直肠下段肠道黏膜充血水肿，刺激肛周的感觉神经后，就会表现出明显的肛门下坠，部分人还会同时伴随腹泻、肛周发痒等其他不适。
3、基础肛肠疾病诱发加重。如果本身就有痔疮、肛窦炎、直肠炎、慢性便秘等基础肛肠或肠道问题，补充益生菌后往往会改变原有排便习惯，比如长期便秘的人排便次数增加，反复排便会摩擦刺激痔核、炎症病灶，进而诱发或者加重肛门下坠的不适。
