正常情况下，质量合格的益生菌产品，最终大概有10%~50%的活性益生菌能活着到达肠道，要是产品本身不合格或者储存不当，可能只有不到10%甚至没有活性菌能抵达。
1. 益生菌入口后第一关就是胃部的强酸环境，健康人胃部pH值很低，大部分不耐酸的益生菌还没出胃就被胃酸杀灭失活，只有做了耐胃酸包埋处理，或者本身就是天然耐酸的菌株，才能闯过这第一关，这一步就会损耗掉50%~90%的初始活性菌。
2. 闯过胃酸之后，益生菌进入肠道还要过胆盐这第二关，胆盐会破坏益生菌的细胞膜结构，不少闯过胃酸的益生菌会在这里再次失活，只有提前筛选出的耐胆盐菌株，才能顺利通过这一关留存下来。
3. 最终的抵达数量还受产品本身条件影响，如果益生菌产品出厂时活性虚标，或者运输、储存过程中没有按照要求控温保湿，很多益生菌在还没被吃进去之前就已经失活，自然最终能抵达肠道的活性菌数量就会大打折扣。
