黄鳝是具有性逆转特性的雌雄同体生物，通过产卵、体外受精的方式繁殖后代。
1. 先形成性别差异：黄鳝从胚胎发育到初次性成熟阶段全都是雌性，完成第一次产卵后，绝大多数个体的卵巢会逐渐转变为能产生精子的精巢，完成性逆转变成雄性，自然环境中通常体长20厘米以下多为雌鳝，40厘米以上基本都是雄鳝，这是黄鳝繁殖的特殊基础。
2. 繁殖期筑巢引雄鳝：黄鳝的繁殖季多集中在春末夏初，水温稳定在20-28℃时，成熟雌鳝会选在岸边水草根下、乱石缝隙或者田埂泥洞中建产卵巢，之后释放信息素吸引雄鳝前来。
3. 受精孵化出幼鳝：雌鳝先把卵产在巢穴中，雄鳝再排出精子完成体外受精，受精结束后雄鳝会守在巢穴附近护卵，避免鱼卵被其他生物捕食，一般经过一周到十天左右的孵化，小黄鳝就会破膜出生，之后独立活动觅食。
