分辨泥鳅公母可通过胸鳍形态、腹部状态、繁殖期特征三个直观特征区分开。
1、看胸鳍外形。公泥鳅的胸鳍整体偏尖长，展开后呈扇形，最前端的第一根鳍骨更粗壮，还会向上翘起，进入繁殖期后胸鳍上会长出白色粗糙的追星凸起；母泥鳅的胸鳍短而圆润，展开后偏椭圆形，第一根鳍骨偏细软也不会上翘，基本不会长出追星。
2、观察触摸腹部。母泥鳅需要怀卵，哪怕是非繁殖期腹部也比公泥鳅更饱满圆润，用手触摸触感偏软，大部分母泥鳅腹中线位置还会有一道清晰的凹痕；公泥鳅的腹部普遍偏扁平偏瘦，触感紧实，没有明显凹痕。
3、看繁殖期的差异。繁殖季节母泥鳅因为怀着鱼卵，腹部会比平时更大更软，整体个头通常也比同龄的公泥鳅更大；公泥鳅身体更纤细灵活，会主动追逐母泥鳅，胸鳍上的追星也更明显，用手摸会有明显的粗糙感。
