由于月饼是采用较难消化的食材制作而成，一般我们食用一小块便有很强的饱腹感，如果食用较多，可能会有严重肠胃不适反应，从而增加肠胃负担。通常正常成年人每日月饼摄入量不宜超过200克，若因食用较多，存在消化不良症状，应立即就医治疗，轻症者可通过腹部按摩、散步等方式缓解。
另外一类是功能性低聚糖，它们不被人体酶系降解，在人体小肠中不被人体吸收，亦不消化，进入人体大肠后，能够促进人体内有益菌的增殖。功能性低聚糖由于功能性以及较好的加工特性，已经被烘焙食品加工企业所认可，添加进面包、蛋糕、以及月饼等产品中。
