慢性肠炎是否严重不能一概而论，多数普通慢性肠炎并不严重，少数控制不佳、合并特殊病变的情况会比较严重。
1、大多数病程平稳的普通慢性肠炎并不严重，这类肠炎一般只是在吃了生冷刺激食物、着凉或者情绪波动后，偶尔出现腹痛、腹泻的症状，调整饮食、休息或者短期对症用药后就能很快缓解，不会对肠道功能和全身健康造成长期损伤。
2、少部分长期反复发作、病因特殊的慢性肠炎会比较严重，比如溃疡性结肠炎、克罗恩病这类炎症性肠病，肠黏膜会长期处于溃疡、糜烂状态，不仅会反复引发严重腹痛、便血，还可能诱发肠穿孔、肠梗阻、脓毒血症等急危并发症，长期患病还会提升结肠**的发病风险，对健康威胁很大。
3、如果慢性肠炎已经引发长期营养吸收障碍，也属于比较严重的情况，这类患者会长期存在体重下降、贫血、乏力的问题，青少年患病还会影响生长发育，这种情况必须及时干预规范治疗，不能放任不管。
