大部分胃部菌群紊乱都可以通过科学的生活、饮食干预得到有效调理，改善胃胀、反酸、消化不良等胃部不适，不需要过度医疗。
1 先从日常饮食调整打基础。日常多搭配全谷物、新鲜蔬果给有益菌提供养分，减少高糖、高油、腌制食物的摄入，这类食物会助长有害菌繁殖；可以每天适当吃点低钠发酵食物，比如无糖原味酸奶、轻度发酵的泡菜、纳豆等，给胃部补充天然有益菌；不要长期顿顿吃精细白米白面，保持饮食结构多样就能给有益菌创造合适的生存环境。
2 避开破坏胃部菌群的常见诱因。最需要注意的就是不要滥用抗生素，不管是感冒还是哪里不舒服，都不要自行长期吃抗生素，这类药物不分好坏杀死胃部菌群，很容易造成菌群紊乱；如果有幽门螺杆菌感染，规范除菌后要及时做菌群调理，不要放任紊乱状态；另外长期吃抑酸胃药也要遵医嘱控制疗程，自行长期吃抑酸药会改变胃部酸碱环境，打乱原有菌群平衡。
3 配合生活干预和针对性补菌改善。如果已经出现明显的胃胀、消化不良等菌群紊乱症状，可以补充耐胃酸的专用益生菌菌株，比如嗜酸乳杆菌、卷曲乳杆菌这类能在胃部酸性环境存活的菌株，不要选普通益生菌，补了也很难发挥作用；同时还要规律作息不要熬夜，长期熬夜、压力焦虑会通过脑肠轴影响胃部菌群稳定，平时多做轻运动、及时疏解压力，对维持胃部菌群平衡帮助很大。
