大多数胃肠菌群失调不需要消炎，只有合并明确细菌感染时才需要遵医嘱规范使用消炎药物。
1. 胃肠菌群失调本身是肠道内有益菌减少、有害菌异常增殖导致的菌群平衡紊乱，日常大家说的“消炎”大多指抗生素类药物，这类药物不分好坏会同时杀灭有害菌和有益菌，盲目用消炎反而会进一步加重菌群失衡，临床上不少胃肠菌群失调本身就是长期滥用抗生素导致的，所以无感染指征时绝对不能随意消炎。
2. 如果胃肠菌群失调同时合并了急性细菌感染，比如出现了高热、脓血便，检查血常规、便常规提示明确的细菌感染指征，这种情况下可以在医生指导下短期用针对性的消炎药物控制感染，不能自行购买滥用，用够疗程就要及时停药。
3. 普通胃肠菌群失调的核心调理方向是帮助菌群恢复平衡，一般通过调整饮食结构（少烟酒、少高油高糖，多吃富含膳食纤维的新鲜蔬果）、规律作息，配合补充肠道益生菌、益生元，多数就能慢慢改善，有腹泻、腹胀等不适时对症缓解即可，不需要盲目消炎。
