目前我国成人肠道菌群失调的发生比例大致在30%~50%区间，具体比例会因人群特征、判定标准不同出现较大浮动。
1. 不同生活状态的成人差异非常明显，长期高油高糖饮食、久坐熬夜、经常饮酒的上班族，菌群失调比例能达到60%以上；而长期保持清淡均衡饮食、规律作息的健康成人，失调比例仅在15%~20%左右；如果是有基础疾病、长期服用抗生素的成人，失调比例甚至会超过80%。
2. 不同研究统计出来的比例差较大，主要是因为目前学界对肠道菌群失调还没有统一的判定标准，有的研究把肠道菌群多样性下降超过25%、有益菌占比降低30%以上判定为失调，有的研究标准更严格，统计出来的比例就会低10~15个百分点，另外如果调查样本来自医院体检人群，本身存在亚健康问题的人更多，统计出来的比例也会比普通社区人群偏高。
3. 近年国内成人肠道菌群失调比例呈明显上升趋势，和10年前相比整体涨幅超过15%，而且年龄结构也出现变化，现在18~35岁的年轻成人失调比例已经反超中老年群体，平均达到45%左右，主要和年轻人不良饮食习惯、精神压力大、不规范使用保健品和抗生素等因素有关。
