大黄米和小米是两种不同物种来源的谷物，在多个方面都存在明显区别。
1.品种来源不同。大黄米是禾本科黍属植物糜子脱壳后得到的米粒，也叫黍米；小米则是禾本科狗尾草属植物谷子脱壳后的产物，二者从植物分类上就不属于同一物种，原作物的生长特性也完全不同。
2.外观和口感不同。大黄米的颗粒比小米大一圈，整体颜色偏浅黄，质地不透明；小米颗粒细小均匀，颜色多是鲜亮的明黄色，质感更通透。口感上，大黄米支链淀粉含量很高，煮熟后粘性十足，吃起来软糯绵密；小米直链淀粉占比更高，煮熟后米粒松散不会发粘，口感清香柔韧，熬煮后还会析出一层浓郁的米油。
3.营养成分和吃法不同。营养上，大黄米的膳食纤维、铁、锌等矿物质含量高于小米，热量和饱腹感也更强；小米的B族维生素、胡萝卜素含量更突出，整体更好消化。吃法上，大黄米因为粘性强，大多用来做粘豆包、黄米凉糕、炸糕、粘粽子这类需要粘性的特色主食；小米最常见的吃法是熬粥，也可以蒸杂粮饭、做小米锅巴，日常饮食中出现的频率更高。
