青萝卜含有一种叫做异硫氰酸酯的化合物，这种化合物在切开或咀嚼时会分解成一种叫做瓜氨酸的物质，瓜氨酸具有辛辣的味道。青萝卜还含有一定的挥发性油，也是厉害的成分之一。这些物质都会给青萝卜带来一定的辛辣感。
水果萝卜发苦主要是品种不纯、种植管理不当、储存不当三个原因造成的。还有不少不良商家会拿普通小萝卜冒充水果萝卜卖，本身就自带苦味。
