肠道细菌产生的B12主要由人体的小肠吸收。B12需要结合一种被称为内因子的蛋白质，内因子由胃部细胞产生。在胃部食物消化的过程中，B12被释放并结合到内因子上。内因子/B12复合物随后进入小肠，在那里B12被吸收并输送到血液中，最终被运输到需要的组织和器官。如果肠道细菌产生的B12无法被吸收，则可能会导致缺乏B12的症状。
健康成年人肠道内的菌群总重量约为1~2公斤，所含细菌数量远超人体自身细胞总数，对人体正常生理运转的重要性相当于一个“特殊核心器官”，全程参与消化、免疫、代谢等多项关键生理活动。
