消化不良的恢复时间从几天到几个月不等，具体取决于诱发原因和病情轻重，多数普通功能性消化不良1~2周就能痊愈。
1. 如果是偶尔饮食不当引发的轻度功能性消化不良，比如一次性吃太多高脂食物、生冷刺激食物导致的肚子胀、打嗝，一般调整饮食、适当休息后，1~7天就能自行缓解，快的1~2天不适感就会完全消失。
2. 如果是反复发作、程度稍重的功能性消化不良，比如长期压力大、作息不规律、胃肠蠕动弱引发的持续性胃胀、反酸，在调整生活习惯的基础上配合服用促胃动力、助消化的药物，大多1~2周就能让症状完全消退。
3. 如果是器质性疾病引发的继发性消化不良，比如胃溃疡、幽门螺杆菌感染、慢性胆囊炎、胰腺炎等疾病导致的消化不良，恢复时间取决于基础疾病的治疗情况：普通溃疡、幽门螺杆菌感染规范治疗后，一般4~6周症状能完全消退；如果是慢性萎缩性胃炎、慢性胆囊炎这类慢性疾病，消化不良症状可能断断续续持续数月，甚至长期反复出现。
