生豆芽变黑的原因可能是因为豆芽生长过程中受到细菌感染，导致豆芽表面生长了一些黑色的霉菌或真菌。如果在豆芽生长过程中，豆子或豆芽有破损或污染，也容易导致豆芽变黑。为了避免豆芽变黑，应该保证豆子的质量和清洁度，控制好生长的温度和湿度，以及注意卫生和消毒。
发好的新鲜豆芽最合适的保存方式是预处理后密封放冰箱冷藏，可保存2-3天保持脆嫩新鲜，无冷藏条件可临时用凉白开浸泡短存，不建议冷冻保存。之后把包装好的豆芽放进冰箱冷藏室中层存放，尽量不要贴在冰箱内壁，避免温度过低冻伤豆芽影响口感，这样存放能保持2-3天的新鲜度。
